Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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