Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms