Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms