Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd2Q0VET5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmntd2Q0VET5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms