Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samd12Q0VE29 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms