Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms