Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc7a1Q09143 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc7a1Q09143 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms