Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MitfQ08874 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms