Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms