Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms