Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgm3Q08189 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms