Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms