Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms