Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms