Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RykQ01887 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RykQ01887 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RykQ01887 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RykQ01887 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RykQ01887 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RykQ01887 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms