Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms