Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms