Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmgcrQ01237 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmgcrQ01237 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms