Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PgrQ00175 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PgrQ00175 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgrQ00175 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms