Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms