Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig3P97386 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig3P97386 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms