Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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