Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad50P70388 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad50P70388 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms