Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NficP70255 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NficP70255 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NficP70255 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms