Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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