Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms