Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms