Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms