Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms