Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5g3P56384 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp5g3P56384 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms