Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms