Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MipP51180 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MipP51180 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MipP51180 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MipP51180 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MipP51180 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms