Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtshP49935 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtshP49935 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtshP49935 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtshP49935 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtshP49935 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtshP49935 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtshP49935 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtshP49935 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtshP49935 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtshP49935 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms