Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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