Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnni3P48787 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnni3P48787 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnni3P48787 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms