Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl13P47963 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl13P47963 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl13P47963 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl13P47963 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl13P47963 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl13P47963 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl13P47963 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13P47963 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13P47963 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13P47963 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13P47963 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13P47963 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13P47963 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13P47963 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13P47963 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13P47963 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms