Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms