Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms