Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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