Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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