Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms