Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms