Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SsbP32067 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SsbP32067 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SsbP32067 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms