Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RxraP28700 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
RxraP28700 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
RxraP28700 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxraP28700 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxraP28700 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RxraP28700 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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