Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms