Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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