Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CftrP26361 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CftrP26361 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CftrP26361 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CftrP26361 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CftrP26361 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CftrP26361 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms