Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms