Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms