Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PparaP23204 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms